Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm28813-201ENSMUST00000186293 1497 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm29324-202ENSMUST00000188242 1497 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm6044-201ENSMUST00000121819 499 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm1322-201ENSMUST00000134620 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 1700030O20Rik-201ENSMUST00000185546 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm29577-201ENSMUST00000186427 693 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Ly6a-202ENSMUST00000186526 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm17979-201ENSMUST00000196646 611 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Nbdy-206ENSMUST00000208373 1061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 AC165254.1-203ENSMUST00000222925 574 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Spats1-201ENSMUST00000024731 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm2098-201ENSMUST00000189146 1763 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Vsnl1-202ENSMUST00000220506 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm16050-201ENSMUST00000160626 2363 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm28670-201ENSMUST00000185365 1498 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm29497-201ENSMUST00000186801 1498 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm28457-202ENSMUST00000191277 1498 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BB287469Q3UT53 Gm37654-201ENSMUST00000193019 1498 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 923.2 ms