Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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PtprkP35822 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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PtprkP35822 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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PtprkP35822 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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PtprkP35822 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Nmnat2-201ENSMUST00000043313 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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PtprkP35822 Fam212b-201ENSMUST00000066610 4701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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PtprkP35822 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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PtprkP35822 Olfr1219-202ENSMUST00000213724 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprkP35822 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm26749-201ENSMUST00000181387 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Arfgef2-201ENSMUST00000099078 8770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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