Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TsksO54887 Erc2-210ENSMUST00000211145 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TsksO54887 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TsksO54887 Cd36-206ENSMUST00000197890 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TsksO54887 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TsksO54887 Rbm43-202ENSMUST00000102768 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TsksO54887 Fbxo11-201ENSMUST00000005504 4019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TsksO54887 Zfp148-201ENSMUST00000089677 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TsksO54887 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TsksO54887 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 Arl6-201ENSMUST00000023405 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 Fbxo16-203ENSMUST00000224629 3781 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 Aldh7a1-208ENSMUST00000174518 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 Nek10-202ENSMUST00000112630 3348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 Sec23a-204ENSMUST00000165134 2529 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TsksO54887 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Cwc22-205ENSMUST00000111824 2603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm12354-201ENSMUST00000124319 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Cdk15-202ENSMUST00000160662 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Sfta2-202ENSMUST00000174521 649 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Tnfaip8-213ENSMUST00000180305 369 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 AC153968.1-201ENSMUST00000215584 334 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 AC132304.1-201ENSMUST00000218860 135 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 AC192333.4-201ENSMUST00000224269 981 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Spats1-201ENSMUST00000024731 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Olfr1388-201ENSMUST00000055584 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Tmem18-201ENSMUST00000057151 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Defa29-201ENSMUST00000098890 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Anpep-202ENSMUST00000107392 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 CT009530.1-201ENSMUST00000227348 2927 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Tyms-201ENSMUST00000026846 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TsksO54887 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Vmn2r30-201ENSMUST00000072475 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm8540-201ENSMUST00000168952 732 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms