Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Parp9-201ENSMUST00000023622 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Ccdc50-ps-201ENSMUST00000118044 941 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm12120-201ENSMUST00000125068 592 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm45549-201ENSMUST00000210180 975 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm10451-202ENSMUST00000219367 855 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr901-201ENSMUST00000063716 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr1303-201ENSMUST00000099609 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Rorc-202ENSMUST00000197040 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm43792-201ENSMUST00000202492 2210 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hps1O08983 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hps1O08983 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hps1O08983 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hps1O08983 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hps1O08983 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hps1O08983 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hps1O08983 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hps1O08983 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hps1O08983 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hps1O08983 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hps1O08983 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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