Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm10286-201ENSMUST00000093603 5077 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Ikbkap-201ENSMUST00000030140 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Adgrl3-209ENSMUST00000119385 4905 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Sez6-201ENSMUST00000000646 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Ttc17-204ENSMUST00000111238 4590 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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