Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndst2-205ENSMUST00000225000 3661 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms