Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Nup210l-202ENSMUST00000200410 5710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp286-201ENSMUST00000054654 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ikbkap-201ENSMUST00000030140 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Srbd1-201ENSMUST00000095187 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rb1cc1Q9ESK9 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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