Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
OtofQ9ESF1 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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