Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Pcdhb8-201ENSMUST00000051163 3334 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm44937-201ENSMUST00000207705 2691 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gpatch2-206ENSMUST00000160471 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Fmr1os-201ENSMUST00000181533 2743 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Arhgap6-205ENSMUST00000112131 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf17Q99MV7 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf17Q99MV7 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf17Q99MV7 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf17Q99MV7 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf17Q99MV7 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Zfp408-202ENSMUST00000111333 3740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Ccdc116-201ENSMUST00000023452 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf17Q99MV7 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf17Q99MV7 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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