Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Lrif1Q8CDD9 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Lrif1Q8CDD9 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Lrif1Q8CDD9 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Lrif1Q8CDD9 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Olfr268-ps1-201ENSMUST00000121395 945 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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