Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp47Q8BY87 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Usp47Q8BY87 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Usp47Q8BY87 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp47Q8BY87 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp47Q8BY87 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp47Q8BY87 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp47Q8BY87 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms