Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Rtkn2-202ENSMUST00000105437 3932 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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NischQ80TM9 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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NischQ80TM9 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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NischQ80TM9 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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NischQ80TM9 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms