Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GcsamQ6RFH4 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms