Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ccdc18Q640L5 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ccdc18Q640L5 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Akap8-201ENSMUST00000002699 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Tdrd1-204ENSMUST00000121249 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccdc18Q640L5 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccdc18Q640L5 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccdc18Q640L5 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccdc18Q640L5 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccdc18Q640L5 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccdc18Q640L5 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Btn2a2-203ENSMUST00000110433 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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