Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Polr3f-201ENSMUST00000028914 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Edc4Q3UJB9 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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