Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
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Traf3ip1Q149C2 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr984-201ENSMUST00000056795 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms