Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm38352-201ENSMUST00000194459 2557 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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