Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Top2aQ01320 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Top2aQ01320 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Top2aQ01320 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Top2aQ01320 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Top2aQ01320 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Top2aQ01320 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms