Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
RxraP28700 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
RxraP28700 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.19
RxraP28700 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
RxraP28700 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
RxraP28700 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms