Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Casp8-202ENSMUST00000165549 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Duxbl2-201ENSMUST00000100810 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms