Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Ppwd1-201ENSMUST00000022226 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Wfikkn2-201ENSMUST00000061469 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Mep1a-201ENSMUST00000024707 2921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Trim43a-201ENSMUST00000164661 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Pygl-202ENSMUST00000161083 2992 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm26800-201ENSMUST00000180871 349 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm26003-201ENSMUST00000083061 113 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Usp9yF8VPU6 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Zfp74-201ENSMUST00000032797 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Usp9yF8VPU6 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Lrrc49-203ENSMUST00000114032 2586 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms