Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Elavl2-203ENSMUST00000107109 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Elavl2-205ENSMUST00000107111 1552 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm25095-201ENSMUST00000104047 131 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm8818-201ENSMUST00000110797 1047 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Rps14-203ENSMUST00000122279 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm24325-201ENSMUST00000175344 74 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm10522-201ENSMUST00000194503 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm43809-201ENSMUST00000200694 338 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rnf4Q9QZS2 Ucma-201ENSMUST00000027978 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr46-201ENSMUST00000072655 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rnf4Q9QZS2 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rnf4Q9QZS2 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm30655-201ENSMUST00000220498 1383 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 9230102K24Rik-201ENSMUST00000219459 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 CT025548.2-201ENSMUST00000226227 1329 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 n-R5s90-201ENSMUST00000103968 118 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms