Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Cul2-201ENSMUST00000025073 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Casp14-202ENSMUST00000219237 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rb1cc1Q9ESK9 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms