Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm14487-201ENSMUST00000145413 1259 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm24786-201ENSMUST00000157379 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Gm9955Q8CEJ8 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Pax4-205ENSMUST00000174194 974 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm22347-201ENSMUST00000180276 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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Gm9955Q8CEJ8 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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Gm9955Q8CEJ8 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm5043-201ENSMUST00000202103 820 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Gm9955Q8CEJ8 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Tex43-201ENSMUST00000035640 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Gm9955Q8CEJ8 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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Gm9955Q8CEJ8 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Gm9955Q8CEJ8 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Gm9955Q8CEJ8 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm9955Q8CEJ8 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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Gm9955Q8CEJ8 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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Gm9955Q8CEJ8 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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Gm9955Q8CEJ8 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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Gm9955Q8CEJ8 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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Gm9955Q8CEJ8 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm9955Q8CEJ8 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms