Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR3

Skida1, SKI/DACH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skida1Q80YR3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Fgg-202ENSMUST00000194175 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Plat-201ENSMUST00000033941 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 BC025920-202ENSMUST00000119492 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Slc24a2-201ENSMUST00000044990 2218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gas2-209ENSMUST00000208711 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Apol10b-201ENSMUST00000089465 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Etfbkmt-202ENSMUST00000111547 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm11431-201ENSMUST00000155046 428 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm20879-201ENSMUST00000188719 695 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Fam209-201ENSMUST00000029007 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Sept11-207ENSMUST00000202217 1380 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Gm42572-201ENSMUST00000202292 3378 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Skida1Q80YR3 Smok4a-202ENSMUST00000144015 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Skida1Q80YR3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Skida1Q80YR3 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Skida1Q80YR3 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Skida1Q80YR3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Skida1Q80YR3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Skida1Q80YR3 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Skida1Q80YR3 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms