Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms