Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms