Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ttc21bQ0HA38 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc21bQ0HA38 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms