Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms