Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Cphx2-201ENSMUST00000168149 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Cphx3-202ENSMUST00000184577 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm16596-201ENSMUST00000180576 604 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 2610037D02Rik-202ENSMUST00000185067 2997 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 AC165254.1-203ENSMUST00000222925 574 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 AC131100.1-201ENSMUST00000226328 470 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Nbdy-206ENSMUST00000208373 1061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
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