Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm26070-201ENSMUST00000157500 137 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Glyatl3-201ENSMUST00000166343 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 2210420H20Rik-201ENSMUST00000188435 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm38433-201ENSMUST00000196978 856 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Ighv8-16-201ENSMUST00000199258 294 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 9530020I12Rik-202ENSMUST00000218368 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm10120-201ENSMUST00000219845 357 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC159649.1-201ENSMUST00000220851 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm9305-201ENSMUST00000220962 599 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Gm46342-201ENSMUST00000223411 602 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm5407-201ENSMUST00000080694 747 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm7275-201ENSMUST00000088296 744 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Palb2-203ENSMUST00000106468 3304 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Rai14-202ENSMUST00000169385 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 A530040E14Rik-201ENSMUST00000093501 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm33994-201ENSMUST00000193724 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Cd300ld-201ENSMUST00000045075 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Lrrc49-202ENSMUST00000065603 3017 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Pde4b-202ENSMUST00000097949 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Zfp541-203ENSMUST00000210805 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Palb2-202ENSMUST00000098068 3750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Sun1-206ENSMUST00000110884 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm37893-201ENSMUST00000192826 2437 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Ttc21a-201ENSMUST00000035100 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm15464-201ENSMUST00000118718 431 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm14860-201ENSMUST00000120277 429 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm4908-201ENSMUST00000121923 1005 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm22198-201ENSMUST00000122659 307 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 E330017L17Rik-204ENSMUST00000145196 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 4930562A09Rik-201ENSMUST00000153818 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms