Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm13750-201ENSMUST00000117621 465 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm29507-201ENSMUST00000187378 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NefhP19246 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm28670-201ENSMUST00000185365 1498 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm29497-201ENSMUST00000186801 1498 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm28457-202ENSMUST00000191277 1498 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm37654-201ENSMUST00000193019 1498 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Asb17-201ENSMUST00000044089 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NefhP19246 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NefhP19246 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms