Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Muc13-202ENSMUST00000115044 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B130021K23Rik-201ENSMUST00000205226 2593 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc1-201ENSMUST00000113421 2630 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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