Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms