Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Gm43161-201ENSMUST00000197020 1688 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Lrif1Q8CDD9 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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