Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm37074-201ENSMUST00000193444 1843 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms