Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Ly6f-201ENSMUST00000023247 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Slc12a8-201ENSMUST00000059056 3166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Vnn1-201ENSMUST00000041416 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 D830044D21Rik-201ENSMUST00000143315 3897 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Prc1-210ENSMUST00000174172 3008 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 4930428N03Rik-204ENSMUST00000224456 3212 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Selenop-203ENSMUST00000159216 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Zmym3-203ENSMUST00000117901 5178 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm43161-201ENSMUST00000197020 1688 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Olfr628-201ENSMUST00000098193 1553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Rtkn2-202ENSMUST00000105437 3932 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Cyb5a-205ENSMUST00000163083 676 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Ckb-ps1-201ENSMUST00000199192 1127 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm11149-202ENSMUST00000215070 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Lcn2-201ENSMUST00000050785 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Ccdc77-201ENSMUST00000032283 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm45062-201ENSMUST00000162564 5842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Ednra-201ENSMUST00000034029 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Olfr170-202ENSMUST00000206562 1417 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm16497-201ENSMUST00000222024 2842 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Nt5dc1-201ENSMUST00000047885 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 2310001H17Rik-202ENSMUST00000181238 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Fmnl1-203ENSMUST00000107027 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm7457-201ENSMUST00000100821 2459 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 4930470B04Rik-201ENSMUST00000192005 1926 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm15028-201ENSMUST00000120295 370 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms