Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm25000-201ENSMUST00000117016 114 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm13682-201ENSMUST00000117524 702 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm8832-201ENSMUST00000119890 395 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm8817-201ENSMUST00000126769 693 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm18822-201ENSMUST00000182857 1025 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm19102-201ENSMUST00000201133 553 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm43461-201ENSMUST00000202351 996 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm44659-201ENSMUST00000207269 436 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm18058-201ENSMUST00000207385 492 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm44714-201ENSMUST00000208665 657 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc153-206ENSMUST00000216632 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm19683-201ENSMUST00000209748 1781 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Tnni2-201ENSMUST00000105971 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Defb20-201ENSMUST00000109836 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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