Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Aasdh-201ENSMUST00000069709 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Rdh12-201ENSMUST00000021548 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gcnt2-201ENSMUST00000067778 4038 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Olfr958-202ENSMUST00000215505 3514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms