Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm43544-201ENSMUST00000196474 2472 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
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