Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms