Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm44834-201ENSMUST00000206671 1396 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Grip1-204ENSMUST00000105261 3608 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm43161-201ENSMUST00000197020 1688 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Irx1P81068 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms