Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm7384-201ENSMUST00000203682 530 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm6072-201ENSMUST00000203989 496 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Olfr61-204ENSMUST00000211685 1212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm2649-201ENSMUST00000218825 610 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Arl15-202ENSMUST00000224068 1002 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Borcs8-201ENSMUST00000002418 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VimP20152 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm15873-201ENSMUST00000123390 761 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm11399-201ENSMUST00000131021 324 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm12996-201ENSMUST00000151670 636 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm44033-201ENSMUST00000203699 695 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 AC211878.7-201ENSMUST00000222851 661 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VimP20152 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm13161-201ENSMUST00000120609 559 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VimP20152 1110059E24Rik-202ENSMUST00000177577 599 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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