Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc180J3QNE4 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc180J3QNE4 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc180J3QNE4 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc180J3QNE4 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc180J3QNE4 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc180J3QNE4 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc180J3QNE4 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc180J3QNE4 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc180J3QNE4 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc180J3QNE4 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc180J3QNE4 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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