Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Tdrd1-204ENSMUST00000121249 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Supt20-202ENSMUST00000170552 1968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms