Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 4930524O08Rik-202ENSMUST00000184444 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Tex24-201ENSMUST00000095375 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm38404-201ENSMUST00000202005 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Rfxank-201ENSMUST00000075724 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC132392.1-202ENSMUST00000216652 2681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Cyp2d37-ps-201ENSMUST00000100380 590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 B430319H21Rik-201ENSMUST00000123420 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 A630023P12Rik-201ENSMUST00000129007 1221 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm15938-201ENSMUST00000150079 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm42605-201ENSMUST00000199565 385 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm43461-201ENSMUST00000202351 996 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm44267-201ENSMUST00000204132 385 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm34611-201ENSMUST00000223252 627 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Rps6-ps2-201ENSMUST00000079841 747 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC154377.1-201ENSMUST00000226752 4979 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm42759-201ENSMUST00000195915 2439 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Pygb-201ENSMUST00000045441 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Wls-201ENSMUST00000068952 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Vsig1-201ENSMUST00000033806 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr6-202ENSMUST00000213552 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Wdr76-202ENSMUST00000099473 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Bank1-205ENSMUST00000198206 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Hk1-203ENSMUST00000116238 3851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm13302-201ENSMUST00000119405 1849 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Numb-201ENSMUST00000021647 1815 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Epn2-202ENSMUST00000108711 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm11565-201ENSMUST00000105053 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm14131-201ENSMUST00000119636 719 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Med6-204ENSMUST00000161211 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm18402-201ENSMUST00000203834 586 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms