Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC8.77□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC8.77□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Traf3ip1Q149C2 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
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Traf3ip1Q149C2 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
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Traf3ip1Q149C2 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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Traf3ip1Q149C2 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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Traf3ip1Q149C2 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm19705-201ENSMUST00000180495 496 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Traf3ip1Q149C2 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms