Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
RxraP28700 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
RxraP28700 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
RxraP28700 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
RxraP28700 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
RxraP28700 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
RxraP28700 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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RxraP28700 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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RxraP28700 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RxraP28700 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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