Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm3745-201ENSMUST00000193773 421 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm34106-201ENSMUST00000193782 503 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 4930474B08Rik-201ENSMUST00000194161 837 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm10522-201ENSMUST00000194503 1163 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm38358-201ENSMUST00000195144 428 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 D830044I16Rik-205ENSMUST00000206296 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Gm39121-201ENSMUST00000208847 525 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm8689-201ENSMUST00000218709 712 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AC159649.1-201ENSMUST00000220851 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AC159263.2-201ENSMUST00000221593 411 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AC122354.1-201ENSMUST00000222328 702 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 AC139130.1-201ENSMUST00000228281 620 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AC118250.2-201ENSMUST00000228890 416 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Tatdn3-202ENSMUST00000085633 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm8605-201ENSMUST00000221619 1370 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm38110-201ENSMUST00000194594 1551 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Teddm1a-201ENSMUST00000050660 1317 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Gm8857-201ENSMUST00000170064 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Gm933-201ENSMUST00000179384 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 n-R5s131-201ENSMUST00000180280 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 1700019D03Rik-204ENSMUST00000186266 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm17978-201ENSMUST00000195986 769 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm45866-201ENSMUST00000212425 326 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm5789-201ENSMUST00000222643 865 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AC126691.2-201ENSMUST00000226185 249 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AC171241.2-201ENSMUST00000228744 892 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Olfr46-201ENSMUST00000072655 957 ntAPPRIS P2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.8 ms