Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 D7Ertd128e-201ENSMUST00000189744 928 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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H2-Eb1P04230 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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H2-Eb1P04230 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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H2-Eb1P04230 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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H2-Eb1P04230 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Cutal-202ENSMUST00000047447 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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